Сервис бесплатных рассылок о Германии
 







 




Ученые составляют каталог клеточных модификаций, указывающих на рак

Генетические изменения в различных клетках порождают сотни форм рака. Именно поэтому ученые сейчас заняты тем, что составляют каталоги этих модификаций (биомаркеров). В дальнейшем эта информация может быть использована для более быстрой и эффективной диагностики. Причем максимально точный результат будет известен уже после анализа крови.

Используя две различные базы данных, исследователи обнаружили свыше 120 биомаркеров, указывающих на рак. После этой находки они проделали масштабную научную работу с привлечением специалистов из Японии и Австралии. В итоге было установлены гены, которые «активируются» при различных типах рака. Есть надежда, что эти биомаркеры помогут выявлять онкологические заболевания на ранней стадии.   

«Активация» гена при раке означает более высокий уровень в зараженных клетках белков или ферментов, которые он производит.  

Исследователи уверены в точности результатов своего исследования, потому как они использовали две различные технологии для обнаружения биомаркеров.

Во-первых, они воспользовались данными, полученными при помощи технологии Cap Analysis of Gene Expression (CAGE), которая является частью проекта FANTOM. Под микроскопом побывали 225 раковых клеток и 339 нормальных.

Затем они проанализировали 4055 первичных опухолей и 563 здоровых тканей из базы данных генома рака Atlas (TCGA). На финальной стадии они сравнили генетические изменения, общие для обеих групп.

В итоге были выявлены 128 биомаркеров.

- В базе данных TCGA хранятся образцы опухолей, которые состоят из смеси различных клеток. В FANTOM хранятся выращенные клетки, из-за чего изменения могут возникать в процессе культивирования. Сравнив данные, мы смогли получить наиболее точную информацию для каталога, - рассказывает автор Богумил Кацковски из центра Life Science Technologies (Япония).

Некоторые из биомаркеров были уже хорошо известны. Например, такие как TOP2A и MKI67. Но исследование также указывает на ряд новых маркеров, в том числе сотни промоутеров – это части генома, которые вызывают экспрессию гена. Они также обнаружили малоизвестный повторяющиеся элемент, названный REP522. Согласно наблюдениям он активируется во многих видах рака.



Кирилл Ефимов











  Карта сайта